Process of Elimination est un jeu d'aventure / réflexion dans lequel le joueur enquête pour déterminer qui est le tueur parmi un groupe de personnages.
Le Duc Ecartelé, un tueur en série tristement célèbre pour avoir assassiné plus d’une centaine de personnes, a plongé le pays dans le chaos à cause de ses actes ignobles. Pour mettre fin à son massacre, l’Alliance des Détectives, composée des meilleurs enquêteurs du monde entier, se réunissent pour lever le voile sur l’identité du tueur.
Cependant, au cours d’une série d’événements imprévus, un jeune mais remarquable détective nommé Wato Hojo se retrouve par hasard dans leur enquête. En rejoignant l’alliance sur la mystérieuse île de Morgue, dans l’objectif de mener l’enquête sur le Duc Ecartelé, il fait une découverte macabre : le tueur se trouve parmi eux ! Est-ce que ces détectives arriveront à prouver leur innocence et découvrir l’identité de la personne qui se cache derrière le Duc Ecartelé ?