Phantom Doctrine est un jeu de stratégie et d'espionnage au tour par tour, style XCOM, se déroulant en période de guerre froide. Mélange d'influences diverses inspiré des films d'espionnage, l'intrigue plonge le joueur dans le monde mystérieux des opérations clandestines, du contre-espionnage et des théories conspirationnistes. En plus des diverses opérations de terrain, le jeu comprend de la gestion de base, études d'informations, entrainement d'agents, et autres éléments propres aux agents secrets et leur monde.
