Situé dans le populaire univers de Warhammer 40,000, Eisenhorn : Xenos est l'adaptation du premier livre de la trilogie Eisenhorn mettant le joueur dans la peau de Gregor Eisenhorn, Inquisiteur de l'Imperium, traquant un criminel sur la planète Hubris afin de déjouer ses plans et mettre à jour une menace plus insidieuse.